晋江历史悠久,早在新石器时代即是古闽人聚居地。春秋战国时越人迁入,融合成为闽越族。
西晋永嘉年间(307~313年),中原战乱不息,大批士庶南迁避乱,在这里沿江而居,称江为晋江。
唐开元六年(718年)析南安县东南部置县,因地处晋江下游而得名。历来是泉州府首邑。宋太平兴国六年(981年)析东乡十六里置惠安县。宋乾道七年(1171年)起兼辖澎湖列岛,清康熙二十二年(1683年)划属台湾府。
新中国成立后晋江行政区域几经析变,1951年划出县城及部分近郊建立泉州市,县治南迁青阳镇;1958年和1971年分别划出部分与泉州近郊相邻地归泉州市管辖;1988年划出石狮等4个乡镇设立石狮市。1992年3月6日,经国务院批准撤县设市。1996年又析池店镇清濛村部分为泉州清濛工业园区。
2001年被列为福建省中等城市,是福建省综合改革试验区、加快闽东南开放开发、建设海峡西岸经济区的前沿区域。